اختلالالت رحم و مجراری خروجی ژتینال
این گروه عامل حدود ۲۰% تا ۲۵% موارد آمنوره اولیه و ۵% موارد آمنوره ثانویه بوده و شامل آژنزی مولرین،هرمافرودیسم کاذب مذکر،پرده بکارت بدون منفذ،وجود دیواره عرضی واژن و سندرم آشرمن می باشد (مورد اخیر عامل آمنوره ثانویه بوده و بقیه موارد موجب آمنوره اولیه می شوند).